Pois bem, consegui realizar a façanha renomeando os diretórios Config para Config_ que ficam nas pastas:
- C:\Windows\Microsoft.NET\Framework64\Old_v4.0.21006 e
- C:\Windows\Microsoft.NET\Framework\Old_v4.0.21006
Só vi que devia fazer isso graças ao último comentário deste bug: http://bugs.mysql.com/bug.php?id=51407 :
"'C:\Windows\Microsoft.NET\Framework\Old_v4.0.30128'
renaming "config" folder to something else."
Uma informação adicional é que no log de eventos, apresenta-se o código de erro 1603, Mensagem: "Status de erro ou êxito da reconfiguração: 1603."